blastpBLAST有什么用?为什么要BLAST?

blastp  时间:2021-08-02  阅读:()

blast+怎么用蛋白序列比对核苷酸序列

不太明白你想问什么。

用vector NTI等软件可以对两个序列进行序列比对,给出的positive值就可以看出同源度了。

若同时拿家族中3个序列进行比对,就可以得到进化树,更直观一点。

blastx是什么?

blast全称是Basic Local Alignment Search Tool,是一种基于序列比对而判断核酸或蛋白的算法。

当你获得了一段DNA序列(或者mRNA序列、蛋白序列等),却不知道它属于哪段基因、有什么作用,就可以尝试用blast,从已知的基因库中找出序列相同或者最相似的基因。

blast有许多不同的子集,比如输入核酸序列寻找核酸的blastn,输入蛋白序列寻找蛋白的blastp。

blastx也是其中一个。

用blastx你可以输入DNA序列,寻找蛋白。

未知的DNA序列可能是正义链也可能是反义链,读码框也有各3种可能,一共是6种可能。

blastx会帮你把这一段序列的6种可能全部翻译成蛋白,分别从库中查找一遍,然后寻找最相似的几个返回结果。

BLAST有什么用?为什么要BLAST?

应该有用途,仅个人所言 ,不太清楚此言的准确性。

BLAST是NCBI中进行序列查找或比对的一个功能,通过序列的BLAST,我们可以找到自己所扩的片段与已测序的片段的一致性,以此推断自己所扩的片段的具体功能,进行序列比对,还可以发现所扩片段的来源生物与其他的生物的亲缘关系

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