并行计算平台与胖节点平台使用说明

winscp  时间:2021-01-03  阅读:()
1.
用户申报平台,平台开通后,账户用户名默认拼音简写,密码默认111111,登录地址:http://172.
24.
43.
2:6080.
同时用户可通过SSHSecureShellClientVNCViewerWinSCP等工具访问平台管理节点.
2.
用户读写存储目录:/public/home/用户名/,可用于读写数据与安装软件;3.
共享软件存储路径:/public/software/.
目前内置GNU编译器、Intel编译器(均适用于C,C++,F77,F90编译),FFTW3-float,FFTW3-double,IntelMKL三款数学库,IntelMPI、OpenMPI两款MPI并行库,以及MATLAB2017可供用户直接使用.
4.
用户在本机测试好程序后,部署到存储目录下,编译程序文件,并调用平台调度软件,执行程序,案例如下:$source/public/software/profile.
d/mpi_openmpi-2.
0.
1-intel.
shMPI程序编译$mpicc–ohellohello.
c$mpif90–ohellohello.
f90准备作业提交脚本hello.
pbs#!
/bin/bash#PBS-Ntest#PBS-lnodes=2:ppn=10#PBS-lwalltime=72:00:00#PBS-qhigh#设置环境变量source/public/software/profile.
d/mpi_openmpi-2.
0.
1-intel.
sh#确定核心数,启动mpi进程NP=$(cat$PBS_NODEFILE|wc–l)mpirun–np$NP–machinefile$PBS_NODEFILE.
/hello#提交作业qsubhello.
pbs5.
并行计算平台包含12个计算节点,comput1,comput2…comput12;队列统一为middle;试用阶段用户可最多同时使用12个节点执行计算,总计算核数336;6.
胖节点平台包含2个队列:fat1,fat2.
节点名称也相应为fat1,fat2;每个用

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