蛋白结构预测为什么要进行蛋白质空间结构预测

蛋白结构预测  时间:2021-09-29  阅读:()

解析蛋白质结构的方法都有哪些?各自的优缺点是什么

目前 有三大主流方法: x-ray(晶体学) nmr(核磁共振) 电镜,三个各有优缺点吧,现在pdb收藏的绝大多数是晶体学方法解出来的结构75%左右,15%是nmr的方法,不过电镜以后会是大趋势,16年之后电镜诗歌非常大的热门,研究人越来越多了

为什么要将多重序列比对引入蛋白质二级结构预测?如何进一步提高蛋白质二级结构预测的准确性?

首先你要知道Protein二级结构预测是有根据的预测 现在的二级结构预测都是建立在蛋白质序列比对的基础上进行的,在已有的数据库基础上,将你的目标序列筛选数据库,比如目标序列中的某一段序列与其他很多蛋白质中跨膜结构域的一级序列相似度极高,那么就可以推测你的目标序列中的这一段序列可能为跨膜结构域。

一般预测结构域的方法是利用2个以上的预测软件进行分析。

我原来也回答过一个关于结构预测的问题,软件多为在线的,提交后网站会返回一个文件,要用特殊的软件来打开。

当然既然是预测就有可能出现错误,更精确地方法就是用实验去验证,比如晶体衍射等方法。

为什么要进行蛋白质空间结构预测

研究蛋白质的结构意义重大,分析蛋白质结构、功能及其关系是蛋白质组计划中的一个重要组成部分。

预测蛋白质结构,有助于了解蛋白质的作用,了解蛋白质如何行使其生物功能,认识蛋白质与蛋白质或其它分子之间的相互作用,这无论是对于生物学还是对于医学和药学,都是非常重要的。

对于未知功能或者新发现的蛋白质分子,通过结构分析,可以进行功能注释,指导设计进行功能确认的生物学实验。

通过分析蛋白质的结构,确认功能单位或者结构域,可以为遗传操作提供目标,为设计新的蛋白质或改造已有蛋白质提供可靠的依据,同时为新的药物分子设计提供合理的靶分子结构。

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