进化树“进化树”可以直观的表示生物之间的亲缘关系和进化历程。从该进化树我们可以推测( ) A.a、b、

进化树  时间:2021-07-28  阅读:()

进化树怎么分析

原发布者:夏末秋初啊 进化树分析步骤一、用CLUSTALX(1.83)排列序列(alignment)方法:1、打开记事本,以FASTA格式粘贴序列到记事本,所有要比对的序列都这么粘贴,格式如下:>aa(序列名称)(序列)>&2、用ClustalX打开记事本文件。

导入第一个文件用loadsequence,后面的文件用appendsequence。

都在file下拉菜单里。

3、用ClustalX排序后,输出格式为*.PHY,保存。

用记事本打开如下图:图中的8和50分别表示8个序列和每个序列有50个碱基。

二、phylip软件进行进化树分析1、打开软件SEQBOOT路径输入刚才生成的*.PHY文件,并在Randomnumberseed(mustbeodd)?的下面输入一个4N+1的数字后,屏幕显示如下:图中的D、J、R、I、O、1、2代表可选择的选项,键入这些字母,程序的条件就会发生改变。

D选项无须改变。

J选项有三种条件可以选择,分别是Bootstrap、Jackknife和Permute。

文章上面提到用Bootstraping法对进化树进行评估,所谓Bootstraping法就是从整个序列的碱基(氨基酸)中任意选取一半,剩下的一半序列随机补齐组成一个新的序列。

这样,一个序列就可以变成了许多序列。

一个多序列组也就可以变成许多个多序列组。

根据某种算法(最大简约性法、最大可能性法、除权配对法或邻位相连法)每个多序列组都可以生成一个进化树。

将生成的许多进化树进行比较,按照多数规则(majority-rule)我们就会得到一个最“逼真”的进化树。

Jackkn

MEGA做出来的进化树要怎么分析

这个问题还是很easy的 MEGA 4 1.打开MEGA4软件 2.在界面中选择Alignment->Alignment Explorer/CLUSTAL 3.在弹出的窗口中选择create a new alignment 4.弹出的窗口中点击no用于蛋白质的分析 输入序列什么的就不说了 5.采用菜单栏Alignment中的Align by ClastalW 6.利用默认参数进行多序列比对 7.点击Data菜单栏中的Exit AlnExplorer 8.点击Yes保存current align session (.mas)及MEGA file(.meg) 9.我暂且认为你是要构建phylogeny,NJ(neighbor joining)和MP(Maximum parsimony)方法都可以,当然还有其他很多方法,依据不同标准,需求选择 10.调好参数,计算就可以了

进化树的构建到底有什么意义

用于简明地表示生物的进化历程和亲缘关系。

进化树就是,生物分类学家和进化论者根据各类生物间的亲缘关系的远近,把各类生物安置在有分枝的树状的图表上。

进化树怎么画啊?

如果是生物进化的进化树,那就从根部开始画,向上不断分支,注意不需太细致,基本上以门或纲来分就可以了,如果想突出一部分就在向下细化。

如果是那种系统进化树,就需选定一个对象,如细胞色素C,通过比对算出进化距离,之后再根据所有的相互距离做出一个树,如果是简单的可以手画,稍微计算设计一下就可以,如果是复杂的,就需用计算机了

如何读懂进化树

进化树在生物学中,用来表示物种之间的进化关系。

生物分类学家和进化论者根据各类生物间的亲缘关系的远近,把各类生物安置在有分枝的树状的图表上,简明地表示生物的进化历程和亲缘关系。

在进化树上每个叶子结点代表一个物种,如果每一条边都被赋予一个适当的权值,那么两个叶子结点之间的最短距离就可以表示相应的两个物种之间的差异程度。

从进化树中还可看出:生物进化有一个规律,都是从水生到陆生,从低等到高等,从简单到复杂。

希望对你有帮助。

“进化树”可以直观的表示生物之间的亲缘关系和进化历程。从该进化树我们可以推测( ) A.a、b、

A 试题分析:A、如图所示的进化树可知a、b、c、d、e五种生物都是由共同祖先f进化而来,但亲缘关系远近不同,故符合题意。

B、如图所示的进化树可知a、b、c、d、e五种生物都是由共同祖先f进化而来,在地层中出现最早的生物是f,C、如图所示的进化树可以发现a、b及c、d间的亲缘关系更近,D、如图所示的进化树可知a、b、c、d、e五种生物都是由共同祖先f进化而来,也就意味着a、b、c、d、e都比f更复杂、更高等、陆生的可能更大,但我们却不能确定a、b、c、d、e之间谁高级谁低等,故B、C、D都不符合题意。

点评:此题为基础题,解答此题的关键是熟练掌握生物进化的历程,可结合生物进化树进行记忆。

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